接下来，大明军队在山口暂做休整后，便迅速拿下广岛、兵库、舞鹤等城。
当大明占下大阪后，便意味着离京都已不远。
不过，此时天皇也已经逃离了京都，暂驻于名古屋。
整个倭国国内大乱，各地大名皆开始扩充兵马，固城自守。
而幕府将军德川家纲此时也开始惴惴不安，不知所措。
“大老，现在该如何是好，明军实力太强，我们打不过呀！”
德川家纲着急地问着酒井忠清。
“先把天皇请回来，以天皇的名义，征集大名们的军队，组织起来，在富士山与明军进行一场决战，利用山川地势或许能打败明军，若不能只能让天皇代表我们向大明投降！”
于是，这德川家纲便果真派人将天皇从名古屋接到了江户，同时又号召各地大名集结武士于富士山，准备于此与大明决战。
而天皇与幕府将军德川家纲也躲入了富士山中。
等着大明陆续占领倭国京都、奈良等城后，于崇祯四十年六月正式抵达东京附近，来到富士山山下，受到三十万倭国日军阻击。
倭国这次还出动了骑兵，但在步炮协同的大明军队面前依旧如土鸡瓦狗般被击溃。
最终倭国日军依旧只得盘在富士山中与大明军队进行周旋。
“这里是倭国最高的地方，而现在倭国的幕府将军与天皇皆在里面，我们得先将藏在这富士山里的倭寇全部歼灭才能有效占据倭国。”
李定国看茫茫大山说了一句。
“可这山势蔓延，林深路险，我军对此地又很陌生，要想全歼倭寇只怕甚为艰难，尽管我军武器优良，但若是分散开，散于群山之中又难免被偷袭伏击，只怕还会增加伤亡，甚至是徒劳无功。”
郑成功不得不补充了一句，一时看着远处白雪皑皑的富士山也不禁喟叹起来。
李定国也同样保持了沉默，诺大个倭国，却因为山地多而给了这些倭寇以暂时的栖身之地，使得明军为避免不必要的伤亡而不得不对其暂时停止进攻。
李定国思索了许久，最终决定采取关门打狗之策，集中二十万明军将整个富士山围住，并不让主力分散进山搜剿，而是在山下扎成一个笼子，两万铁骑分成十班昼夜不断地围绕着整个富士山巡逻。
同时，李定国又选出仅有五千之数的特战士兵手持冲锋枪与腰挂震天雷，分散进山中，袭击躲于山里的倭寇，但并不将其剿灭，只是驱赶出来，由山下的主力负责剿灭这些倭寇。
总而言之，便是让主力部队在外面扎笼子，而让最精干的明军充当猎犬，进入猎场将所有被视为猎物的倭国驱赶出来，也可以说成是搂草打兔子。
现在的倭寇皆密布于富士山山中，且借着自己对于这一带的地势的熟悉，很是安然地在山中负隅顽抗。
“将军，我们会击败明军吗，明军会闯进山里来杀掉我们吗？”
倭寇天皇问着幕府将军德川家纲，德川家纲冷冷一笑：“天皇放心，大老酒井精忠说了，我们现在在富士山里，就像是鱼游回大海一样，他们很难找到我们的，而要想找到我们只能分兵各处寻找，到时候我们就有机会放冷箭冷枪袭击他们，让他们有来无回。”
“将军睿智！”倭国天皇点了点头，也就稍微安心了不少。
而这时候，哒哒的枪声响起，明军特战官兵持着冲锋枪突然出现在了附近，对着这些倭寇就是一顿猛烈地扫射，然后大喊着杀，生怕这些倭寇不知道自己的出现。
倭寇因此大为慌张，德川家纲和倭国天皇皆忙在自己的部下护卫下往外跑。
这样的场景在接下来的一段时间里不断地发生着，这些藏在富士山山里的倭寇们就像是兔子一样被明军追的到处跑。
而此时的大明军队主力则以逸待劳地等在山下，一旦有一股倭寇跑到了山下，就毫不客气地聚歼，或者将其打回去，使得这些倭寇现在是想下山也不行，而在山中也不安宁，整个富士山里的倭寇就一直处于奔波的状态，没有精力闲下来种田积蓄力量。
但偏偏山下的明军主力则在山下把根基扎得越发的稳固，搜剿倭寇大名的财富，建立统治秩序，积蓄后勤资源。
使得一年之内，还留在山中的幸存之倭寇越来越少，即便还有也是饥寒交迫，因为生产资料的短缺而不得不忍饥挨饿。
“将军，我好饿，我真的好饿”，倭国天皇已经变得没有牛气。
而之前还能大鱼大肉但现在也只能喝粥度日的德川家纲也很是无奈地道：“我也吃不饱饭了。”
而此时，大明已经开始采用了政治攻势，派遣已经训练的普通倭人平民跟随明军特战士兵进入山中敲锣高喊道：“尔等倭人听好了，擒获倭国幕府将军德川家纲或倭寇天皇者，赏黄金千两，并饶其一命！”
这个价格不可谓不诱人，但在临近死亡与饥饿的边缘，尽管有武士还忠于这些倭国贵族，但更多的是开始想以此为拯救自己。
连带德川家纲都想把倭国天皇给卖出去，但他又担心倭国天皇转眼又把自己给卖了，因而一直把倭国天皇带在身边。
“他们就是天皇和将军，他们就是！”
这时候，最先出卖德川家纲和倭国天皇则是大老酒井精忠，一见明军出现，就忙站起来指着德川家纲与倭寇天皇喊了起来。
而德川家纲现在恨死了这酒井精忠，不由得大怒：“你为何出卖我？”
“没有办法，我还想活命！”
酒井精忠刚说完，此时一武士就把一倭刀捅进了酒井精忠的肚子：“不忠不义的家伙，我替将军杀了你！”
但是现在明军已经走了过来，问着德川家纲和倭国天皇以及他们身边的那名武士。
“你们谁是天皇和将军？”
“他是！”
德川家纲与倭国天皇都指向了那名刚刚杀掉酒进精忠的武士。
那名武士有些愕然，有些后悔，也有些失望。
“奇怪，听闻倭国天皇和将军不是同一个人，为何今日却变成了同一个人，这人看上去一脸老实样，明显不是什么天皇和将军，尔等在骗我们！”